除开益生菌的活性、数量之外，益生菌的菌株也是十分关键的，但经常被大家忽视。我们在挑选酸奶的时候，也经常会忽视这些。同等活性，同样数量下，益生菌的菌株不一样，耐受胃酸、胆汁等分泌物的能力也会不一样，益生菌抵达肠道的数量各有不同，对人体的作用也是有挺大的差异。

普遍的益生菌主要有三大类，双歧杆菌类、乳酸杆菌类、链球菌类，但每一类都包含很多种，每一种也会细分化为许多不一样的菌株，确切的说，每款益生菌产品都是要具体到菌株的，仅仅由于某些原因沒有标注罢了。现阶段国际上较为著名的益生菌是双歧杆菌BB-12、鼠李糖杆菌LGG。

依据2003年在我国卫生部文件，现阶段有可用于保健食品的益生菌有10种，但2011年、2014年后文件表明，这其中可以应用于婴幼儿食品的益生菌则是少之又少，只能很少数的6株，因此，针对月龄较小的宝宝，尽可能挑选这6株菌中的益生菌产品。

在挑选益生菌时，一定要非常注意益生菌的菌株，并不是所有的益生菌都适合宝宝。

不过，除开益生菌的活性、含量、菌株之外，在挑选益生菌时，还要参照一些别的因素，例如日期是不是新鲜、生产地、别的的配料成分等。尽可能选择日期新鲜，产地纯净、沒有别的多余成分的优质益生菌产品。